9月14日因應莫蘭蒂颱風來襲，大台南公車各路線原則正常發車至18:00（含原訂18:00發車各班次）。各主要路線末班車如下：
綠幹線：安平工業區18:00開，玉井18:00開
藍幹線：安平工業區18:00開，佳里18:00開
棕幹線：新營17:35開，佳里19:05開
橘幹線：佳里18:00開，玉井18:00開
黃幹線：白河18:00開，麻豆20:00開
紅幹線：安平工業區18:00開，關廟18:00開
0左：台南火車站18:20開
0右：台南火車站18:10開
1路：成功橋18:00開，台南火車站18:50開
2路：白鷺灣社區19:15開，崑山科技大學18:00開
3路：海東國小18:00開，竹篙厝19:15開
5路：桂田酒店19:00開，市立醫院18:00開
6路：下鯤鯓19:10開，裕聖里18:08開
7路：台南火車站18:00開，康寧大學18:50開
9路：台南火車站18:00開，公親里18:50開
10路：鹿耳門18:50開，台南火車站18:30開
11路：大成路口18:28開，城西里19:30開
14路：億載金城18:45開，台南火車站18:20開
15路：奇美醫院18:00開，大成國中18:50開
18路：國民路19:00開，塭南里18:00開
19路：原住民文化會館18:00開，大灣高中19:00開
20路：夢時代18:00開，海東國小19:30開
21路：台南火車站18:00開，永康休閒育樂中心19:30開
77路：原住民文化會館18:15開，南紡購物中心 18:15開
88路、99路：18:00以後停駛
高鐵快捷公車H31、H62：依班表正常營運，並配合高鐵行駛狀況調整。
黃9線：依班表（假日前一日班次）正常營運，並配合高鐵行駛狀況調整。
66路：新營11:00 13:00班次停駛
部分路線班次可能因路況或天候影響有所調整，屆時將另行公告，敬請注意大台南公車及相關網站公告訊息。